Para 2011, la Administración Portuaria Integral de Ensenada tiene como meta ejecutar un presupuesto de $744. 520 millones de pesos entre recursos propios y federales, en obras de protección portuaria.
La principal de las obras proyectadas es la prolongación del rompeolas y deflector de oleaje en el Puerto de Ensenada, la 2da Etapa del Centro Regulador de Transporte, modernización de accesos al puerto y la supervisión de la 2da etapa de la aduana, cuya licitación se encuentra en proceso por el SAT para ser adjudicada en Febrero.
Además de la ampliación del muelle de carga de 50 mts del Puerto de Ensenada, que se complementará con los nuevos espacios y servicios de valor agregado a la carga como el Punto de Inspección y Verificación Fitozoosanitaria y Bodega, cuya inversión en 2010 fue de $4 millones de pesos.
Para el Puerto de El Sauzal, se proyecta redimensionar el proyecto de infraestructura para el sector pesquero, se contempla la ampliación del muelle 1 de pesca del puerto, la mejora de accesos desde el nodo vial hasta la entrada al puerto e iluminación.